Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN19Q8N6F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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