Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms