Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC47Q8N1G4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC47Q8N1G4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
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