Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms