Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLD3Q8IV08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLD3Q8IV08 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms