Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms