Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC84Q86UT8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms