Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PBRM1Q86U86 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PBRM1Q86U86 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms