Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM220AQ7Z4H9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms