Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD1L3Q7Z443 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms