Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT27Q7Z3Y8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms