Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms