Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY3Q7L099 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms