Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS12Q6ZW61 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms