Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX8Q6ZV50 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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