Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC73Q6ZRK6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms