Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CASC2Q6XLA1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms