Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPNTQ6UXI9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPNTQ6UXI9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms