Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC171Q6TFL3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms