Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1Q6PKG0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms