Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1AQ6PJP8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms