Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms