Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 TTLL5-213ENST00000555422 2155 ntTSL 57.65□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GTF2H1-205ENST00000525831 545 ntTSL 47.48□□□□□ -1.218e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GEMIN6-203ENST00000409566 834 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.218e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 SUSD1-207ENST00000482851 672 ntTSL 37.47□□□□□ -1.218e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ETFA-214ENST00000560345 717 ntTSL 47.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF619-210ENST00000522736 2030 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.298e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CNOT9-203ENST00000418808 907 ntTSL 36.99□□□□□ -1.291e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ARFGAP3-202ENST00000435208 501 ntTSL 36.95□□□□□ -1.38e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.338e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 COPS2-207ENST00000560240 514 ntTSL 46.7□□□□□ -1.348e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPBAP1-202ENST00000463266 481 ntTSL 26.56□□□□□ -1.368e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GTF2H1-212ENST00000532227 770 ntTSL 36.47□□□□□ -1.378e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 PCGF1-206ENST00000489914 433 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.458e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.498e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.514e-14■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ABHD6-204ENST00000475982 593 ntTSL 55.07□□□□□ -1.68e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ETFA-209ENST00000559758 893 ntTSL 24.96□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.652e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 54.74□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-207ENST00000587880 524 ntTSL 34.67□□□□□ -1.668e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.688e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.688e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPBAP1-204ENST00000467643 838 ntTSL 1 (best)4.37□□□□□ -1.718e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DRAM1-203ENST00000546729 535 ntTSL 24.25□□□□□ -1.738e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CNOT10-217ENST00000485136 608 ntTSL 24.21□□□□□ -1.748e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.758e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-217ENST00000521038 427 ntTSL 53.71□□□□□ -1.828e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.851e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 OXSR1-205ENST00000483695 769 ntTSL 23.51□□□□□ -1.858e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CNOT9-206ENST00000473626 556 ntTSL 43.5□□□□□ -1.851e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPBAP1-206ENST00000478601 635 ntTSL 53.38□□□□□ -1.878e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 TMEM131-206ENST00000469447 602 ntTSL 33.31□□□□□ -1.888e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 NCAPD2-213ENST00000545732 543 ntTSL 53.21□□□□□ -1.98e-9■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 DRAM1-204ENST00000549066 427 ntTSL 32.93□□□□□ -1.948e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 TTLL5-209ENST00000554935 528 ntTSL 42.35□□□□□ -2.035e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 IDE-207ENST00000492362 747 ntTSL 22.29□□□□□ -2.041e-7■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATP13A3-207ENST00000484023 522 ntTSL 22.23□□□□□ -2.058e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CNOT10-208ENST00000463006 692 ntTSL 31.79□□□□□ -2.128e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.268e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 BMI1-210ENST00000602524 545 ntTSL 30.64□□□□□ -2.318e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-205ENST00000395374 2761 ntTSL 20.15□□□□□ -2.398e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 PCM1-217ENST00000522998 493 ntTSL 3-0.73□□□□□ -2.532e-6■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 A2M-205ENST00000472360 692 ntTSL 26.5□□□□□ -1.375e-21■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ARFGAP3-203ENST00000437119 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.97e-8■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRDX6-203ENST00000470017 859 ntTSL 26.14□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 40.4
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PRPF8Q6P2Q9 PRR5-205ENST00000431834 1612 ntTSL 524.31■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 40.4
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PRPF8Q6P2Q9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-209ENST00000457960 881 ntTSL 520.1■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 40.4
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PRPF8Q6P2Q9 PRR5-207ENST00000432916 1430 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-214ENST00000492475 920 ntTSL 512.17□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-ARHGAP8-204ENST00000515632 1590 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRR5-ARHGAP8-203ENST00000495250 1271 ntTSL 211.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 40.4
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PRPF8Q6P2Q9 SART3-208ENST00000547528 1935 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 SART3-206ENST00000546815 2318 ntTSL 58.93□□□□□ -0.984e-8■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRC1-206ENST00000555455 830 ntTSL 310.46□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRC1-217ENST00000560423 755 ntTSL 35.31□□□□□ -1.563e-11■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 55.1□□□□□ -1.593e-11■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-205ENST00000518419 567 ntTSL 416.34■□□□□ 0.212e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-210ENST00000520076 570 ntTSL 416.25■□□□□ 0.192e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-203ENST00000517450 550 ntTSL 410.45□□□□□ -0.742e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-225ENST00000524339 811 ntTSL 210.13□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-209ENST00000519820 582 ntTSL 29.82□□□□□ -0.842e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-223ENST00000523431 784 ntTSL 59.65□□□□□ -0.872e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-207ENST00000519464 1006 ntTSL 59.65□□□□□ -0.872e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-219ENST00000522520 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.892e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-202ENST00000517353 841 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-222ENST00000523361 540 ntTSL 59.25□□□□□ -0.932e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-211ENST00000520604 664 ntTSL 35.03□□□□□ -1.62e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.632e-13■■■■■ 40.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND1-215ENST00000521742 614 ntTSL 34.52□□□□□ -1.692e-13■■■■■ 40.4
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