Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms