Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWSAP1Q6NVH7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms