Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms