Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCSD1Q6JBY9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms