Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL2Q6F5E8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms