Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms