Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms