Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCERG1LQ5VWI1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms