Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms