Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH2Q5VUJ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH2Q5VUJ6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms