Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATAD3CQ5T2N8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATAD3CQ5T2N8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms