Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NHSL1Q5SYE7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NHSL1Q5SYE7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms