Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC39AQ5SRH9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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