Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms