Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD3Q5JV73 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms