Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMER1Q5JTC6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMER1Q5JTC6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMER1Q5JTC6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMER1Q5JTC6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMER1Q5JTC6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMER1Q5JTC6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMER1Q5JTC6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
AMER1Q5JTC6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms