Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms