Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms