Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVEP1Q4LDE5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms