Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP221Q4G0U5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms