Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE2Q495Y8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE2Q495Y8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms