Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms