Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPRNQ16849 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRNQ16849 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRNQ16849 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRNQ16849 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRNQ16849 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRNQ16849 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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