Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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