Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKN1Q16512 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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