Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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