Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.48■□□□□ 0.713e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.13e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.99□□□□□ -0.813e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.99□□□□□ -0.813e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.6□□□□□ -1.513e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TSC22D4-203ENST00000423266 1071 ntTSL 217.95■□□□□ 0.466e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)28.5■■■□□ 2.153e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)25.32■■□□□ 1.643e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.333e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)23.16■■□□□ 1.33e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.33e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.433e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 57.69□□□□□ -1.183e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 45.07□□□□□ -1.63e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EDA-211ENST00000530321 339 ntTSL 23.97□□□□□ -1.773e-37■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 AL121845.2-202ENST00000476221 446 ntTSL 519.77■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.138e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.088e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.143e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)26.9■■□□□ 1.92e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.743e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 325.1■■□□□ 1.613e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.553e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.473e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.432e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.383e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)23.69■■□□□ 1.382e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)23.67■■□□□ 1.382e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 223.67■■□□□ 1.382e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.343e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 223.18■■□□□ 1.33e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.33e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.21e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.21e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.163e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ATP6AP1-209ENST00000491569 2079 ntTSL 222.15■■□□□ 1.143e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.133e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 321.97■■□□□ 1.112e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-205ENST00000432449 566 ntTSL 521.97■■□□□ 1.112e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-208ENST00000445308 955 ntTSL 221.51■■□□□ 1.032e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TMEM189-205ENST00000453505 2028 ntTSL 1 (best)21.07■□□□□ 0.962e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 520.92■□□□□ 0.941e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.932e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 AGRN-208ENST00000479707 584 ntTSL 320.82■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.782e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 BCL3-203ENST00000444487 923 ntTSL 519.82■□□□□ 0.763e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 LRP1-203ENST00000451724 1284 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-206ENST00000437868 2033 ntTSL 1 (best)19.12■□□□□ 0.653e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-211ENST00000623253 573 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.473e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.442e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-212ENST00000494142 3039 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.253e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 516.19■□□□□ 0.183e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 215.31■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CTIF-210ENST00000591412 491 ntTSL 314.8□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 NCOR2-209ENST00000440187 467 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 RIN2-205ENST00000467569 871 ntTSL 514.18□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 USP22-211ENST00000584538 554 ntTSL 413.1□□□□□ -0.311e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 RIN2-203ENST00000459721 437 ntTSL 512.73□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.393e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 PTPRF-204ENST00000412568 4154 ntTSL 511.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.583e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 USP22-202ENST00000455117 677 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.73e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CD99-201ENST00000381177 756 ntTSL 210.49□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-13■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 RIN2-207ENST00000488077 462 ntTSL 57.74□□□□□ -1.173e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-10■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.175e-18■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-11■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-11■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.222e-11■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CYP27A1-204ENST00000466602 1210 ntTSL 225.51■■□□□ 1.679e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.979e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 220.7■□□□□ 0.99e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-203ENST00000586916 769 ntTSL 320.55■□□□□ 0.889e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CANT1-213ENST00000592033 502 ntTSL 220.55■□□□□ 0.889e-8■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 CYP27A1-203ENST00000445971 903 ntTSL 519.67■□□□□ 0.749e-8■■■■□ 20.8
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